### 一、需求分析与规划

1. **用户角色定义**：确定系统中的用户角色，如顾客、店员、管理员等。

2. **功能需求**：列出所有需要的功能，例如菜单展示、扫码点餐、订单管理、支付集成、门店管理等。

3. **系统流程图**：绘制系统流程图以明确各功能间的交互关系。

### 二、技术选型

1. **小程序平台**：选择微信或支付宝小程序平台进行开发。

2. **后端技术栈**：常用的有node.js, python (django, flask), java (spring boot), php, ruby on rails等。

3. **数据库选择**：根据需要选择合适的数据库，如mysql, postgresql, mongodb等。

4. **第三方api**：集成支付接口（如微信支付、支付宝支付）、短信验证等服务。

### 三、系统设计

1. **架构设计**：确定系统的架构，例如单体应用、微服务或者服务器less架构。

2. **数据库设计**：设计数据库模型和结构，确保数据的一致性和效率。

3. **接口设计**：设计前后端交互的api接口。

### 四、小程序前端开发

1. **ui/ux设计**：设计用户界面和用户体验。

2. **前端编码**：使用小程序开发框架（如微信小程序的wxml、wxss、js）编写前端代码。

3. **功能实现**：实现扫码点餐、菜单浏览、下单结算等功能。

### 五、后端开发

1. **搭建服务器**：设置服务器环境，部署后端代码。

2. **业务逻辑编写**：根据需求实现业务逻辑，如订单处理、支付流程等。

3. **安全性考虑**：实现数据加密、验证用户输入、防御常见网络攻击等安全措施。

### 六、测试

1. **单元测试**：对后端的关键功能进行单元测试。

2. **集成测试**：测试小程序与后端服务的集成是否正常工作。

3. **性能测试**：确保系统在高并发情况下依然稳定运行。

### 七、部署上线

1. **环境配置**：配置生产环境，包括服务器、数据库、第三方服务等。

2. **上线准备**：完成小程序的审核与发布流程。

3. **监控与维护**：上线后监控系统运行状态，及时处理可能出现的问题。

### 八、运营与维护

1. **用户反馈收集**：收集用户的反馈，持续优化产品。

2. **功能迭代**：根据市场变化和用户需求更新功能。

3. **技术支持**：提供技术支持，解决用户在使用过程中遇到的问题。

开发一个单商户多门店扫码点餐小程序系统是一项综合性工程，需要跨领域的知识和技能。务必在项目开始前做好充分的准备工作，并在开发过程中不断测试和优化，以确保终产品的质量和用户体验。